Dates range from 12/29/08 to 12/20/09.  Western titles where applicable.

1. [DS] Dragon Quest IX: Sentinels of the Starry Skies (Square Enix / Level-5) 4,089,136
2. [DS] Pokemon Heart Gold / Soul Silver (Pokemon / Game Freak / Creatures Inc.) 3,301,873
3. [DS] Friend Connection (Nintendo) 2,059,236
4. [Wii] New Super Mario Bros. Wii (Nintendo) 1,897,089
5. [Wii] Wii Sports Resort (Nintendo) 1,499,058
6. [PS3] Final Fantasy XIII (Square Enix) 1,455,505
7. [Wii] Wii Fit Plus (Nintendo) 1,205,424
8. [Wii] Monster Hunter TRI (Capcom) 949,095
9. [PSP] Monster Hunter Freedom Unite THE BEST (Capcom) 878,880 / 1,080,715 ltd.
10. [DS] Inazuma Eleven 2: Threat of the Invaders: Fire / Blizzard (Levle-5) 851,175
11. [DS] Mario & Luigi: Bowser's Inside Story (Nintendo / Alphadream) 708,311
12. [DS] Kingdom Hearts 358/2 days (Square Enix / h.a.n.d.) 571,981
13. [PS3] Resident Evil 5 (Capcom) 552,553
14. [PS3] Yakuza 3 (SEGA) 525,826
15. [Wii] Wii Fit (Nintendo) 499,251 / 3,470,235 ltd.
16. [DS] Professor Layton and the Flute of Malevolent Destiny [Level-5 / Brownie Brown] 481,311
17. [PSP] Phantasy Star Portable 2 (SEGA / Alfa System) 415,522
18. [Wii] Mario Kart Wii (Nintendo) 404,751 / 2,447,964 ltd.
19. [PSP] Dynasty Warriors Strikeforce (KOEI / Omega Force) 397,080 
20. [DS] Pokemon Mystery Dungeon: Explorers of Sky (Pokemon / Chunsoft) 383,226
21. [Wii] Taiko Drum Master Wii (Namco) 375,895 / 625,391 ltd.
22. [PS3] Pro Evolution Soccer 2010 (Konami) 370, 831
23. [DS] Rhythm Heaven (Nintendo / THX) 361,292 / 1,763,270 ltd.
24. [PS3] Tales of Vesperia (Namco / Namco Tales Studio) 352,961
25. [PSP] Tales of the World: Radiant Mythology 2 (Namco / Alfa System) 339,523
26. [DS] Pokemon Platinum (Pokemon / Game Freak / Creatures Inc.) 325,531 / 2,536,712 ltd.
27. [PSP] Mobile Suit Gundam: Gundam Vs. Gundam Next Plus (Bandai / BEC) 323,531
28. [DS] Style Savvy (Nintendo / synSophia) 314,832 / 861,393 ltd.
29. [DS] Ace Attorney Investigations: Miles Edgeworth (Capcom) 313,891
30. [PS2] SD Gundam G Generation Wars (Bandai / Banpresoft) 306,895

Publisher counts

1. Nintendo: 9
2. Bandai Namco: 5
3. Capcom: 4
4. Square Enix: 3
5. Pokemon: 3
6. Level-5: 2
7. SEGA: 2
8. KOEI: 1
9. Konami: 1

Platform counts

1. Nintendo DS: 12
2. Wii: 7
3. PlayStation 3: 5
4. PSP: 5
5. PlayStation 2: 1

Genre counts

1. RPG: 13
2. Action: 3
3. Adventure: 3
4. Simulation: 3
5. Sports: 2
6. Fitness: 2
7. Music: 2
8. Racing: 1
9. Fighting: 1

No Uncharted 2 = FAIL

EDIT: And I don't care if he's from planet Zeta-12F, let alone Japan.

@ Dr. Grass

This isn't quality, but sales. And bundle sales aren't included here either by the looks of things.

Bundles are included, otherwise FFXIII would be ~100k lower and MH3 would be ~20k lower.

Oh ok. Thanks.

Pretty useless thread then.

EDIT: That comment was rude and uncalled for - I apologize. It's called sour grapes. 

Yeah i just noticed, when looking at FF13's numbers i actually looked at WF+'s numbers

@Dr. Grass... This is a thread about sales, in the sales discussion on a sales website... Explain how it's useless?

Sour grapes dammit!

i.e I admitted I was wrong to be so rash and the only reason I did it was because of making a comment too quickly. I'm playing Uncharted2 at the mo so you can't really blame me can you :P ? Just forget about it plz

I will never forget!

I guess this top 30 proves that RPG aren't in a downward slope, in a crisis, or a dying genre, if they take 13 of the 30 spots (43%). They're still the biggest genre in Japan, with huge margin

VGC's top 50 for comparison:

1		Dragon Quest IX: Hoshizora no Mamoribito ドラゴンクエストIX 星空の守り人	Square Enix	24	4,104,486	4,104,486
2		Pocket Monsters Heart Gold / Soul Silver ポケットモンスターハートゴールド / ソウルシルバー	Nintendo	15	3,341,294	3,341,294
3		Tomodachi Collection トモダチコレクション	Nintendo	27	2,070,282	2,070,282
4		New Super Mario Bros. Wii ニュースーパーマリオブラザーズ Wii	Nintendo	5	1,947,571	1,947,571
5		Final Fantasy XIII ファイナルファンタジー XIII	Square Enix	1	1,508,558	1,508,558
6		Wii Sports Resort Wii スポーツ リゾート	Nintendo	26	1,481,209	1,481,209
7		Wii Fit Plus Wiiフィットプラス	Nintendo	12	1,184,627	1,184,627
8		Monster Hunter 3 tri- モンスターハンター3 (トライ)	Capcom	21	963,966	963,966
9		Monster Hunter Portable 2nd G モンスターハンターポータブル 2nd G	Capcom	91	892,653	3,596,554
10		Inazuma Eleven 2: Kyoui no Shinryokusha イナズマイレブン2 脅威の侵略者 ファイア/ブリザード	Level 5	12	806,544	806,544
11		Mario & Luigi RPG 3 マリオ&ルイージRPG3!!!	Nintendo	45	732,269	732,269
12		Wii Fit Wiiフィット	Nintendo	108	575,112	3,599,891
13		Kingdom Hearts 358/2 Days キングダム ハーツ 358/2 Days	Square Enix	30	537,771	537,771
14		Layton Kyouju to Majin no Fue レイトン教授と魔神の笛	Level 5	4	499,005	499,005
15		BioHazard 5 バイオハザード5	Capcom	42	488,378	488,378
16		Ryu Ga Gotoku 3 龍が如く3	Sega	14	477,711	477,711
17		Rhythm Tengoku Gold リズム天国ゴールド	Nintendo	73	456,363	1,823,792
18		Mario Kart Wii マリオカートWii	Nintendo	89	423,232	2,417,276
19		Pokémon Fushigi no Dungeon: Sora no Tankentai ポケモン不思議のダンジョン 空の探検隊	Nintendo	36	406,230	406,230
20		Phantasy Star Portable 2 ファンタシースターポータブル2	Sega	3	405,483	405,483
21		Taiko no Tatsujin Wii 太鼓の達人Wii	Namco Bandai	49	396,521	635,897
22		Shin Sangoku Musou Multi Raid 真・三國無双 MULTI RAID	Koei	43	376,229	376,229
23		World Soccer Winning Eleven 2010 ワールドサッカー ウイニングイレブン2010	Konami	9	363,343	363,343
24		Pocket Monsters Platina ポケットモンスター プラチナ	Nintendo	67	356,782	2,591,004
25		Tales of Vesperia テイルズ オブ ヴェスペリア	Namco Bandai	14	339,793	339,793
26		Machi e Ikouyo: Doubutsu no Mori 街へいこうよ どうぶつの森	Nintendo	57	330,621	1,220,813
27		Wagamama Fashion: Girls Mode わがままファッション Girls Mode	Nintendo	60	328,150	880,771
28		Tales of the World: Radiant Mythology 2 テイルズ オブ ザ ワールド レディアント マイソロジー 2	Namco Bandai	14	324,299	324,299
29		Mobile Suit Gundam: Gundam vs. Gundam NEXT PLUS 機動戦士ガンダム カンダムVS.ガンダム NEXT PLUS	Namco Bandai	3	315,823	315,823
30		Hoshi no Kirby: Ultra Super Deluxe 星のカービィ ウルトラスーパーデラックス	Nintendo	65	314,279	1,214,103
31		SD Gundam G Generation Wars SDガンダム Gジェネレーションウォーズ	Namco Bandai	10	302,136	302,136
32		Gyakuten Kenji 逆転検事	Capcom	15	291,450	291,450
33		Final Fantasy Crystal Chronicles: Echoes of Time ファイナルファンタジー・クリスタルクロニクル エコー	Square Enix	47	289,276	289,276
34		Power Pro Kun Pocket 11 パワプロクンポケット11	Konami	40	283,015	387,503
35		Wii Sports Wii スポーツ	Nintendo	161	274,850	3,645,284
36		New Super Mario Bros. ニュースーパーマリオブラザーズ	Nintendo	188	263,363	5,792,477
37		Oide yo Doubutsu no Mori おいでよ動物の森	Nintendo	213	254,376	5,268,584
38		World Soccer Winning Eleven 2009 ワールドサッカー ウイニングイレブン 2009	Konami	60	253,734	253,734
39		Gran Turismo グランツーリスモ	Sony Computer Entertainment	12	250,682	250,682
40		World Soccer Winning Eleven 2009 ワールドサッカーウイニングイレブン2009	Konami	59	249,471	249,471
41		Dissidia: Final Fantasy ディシディア ファイナルファンタジー	Square Enix	36	240,709	905,109
42		Monster Hunter G モンスターハンターG	Capcom	17	240,551	240,551
43		Jikkyou Powerful Pro Yakyuu Portable 4 実況パワフルプロ野球ポータブル4	Konami	14	236,873	236,873
44		Kidou Senshi Gundam Senki U.C. 0081 機動戦士ガンダム戦記 U.C.0081	Namco Bandai	9	232,273	232,273
45		Mario Kart DS マリオカートDS	Nintendo	214	225,348	3,687,784
46		Musou Orochi Z 無双 OROCHI Z	Koei	11	220,346	220,346
47		Made in Ore メイドイン俺	Nintendo	34	219,400	219,400
48		Wii de Asobu Mario Tennis GC Wiiであそぶ マリオテニスGC	Nintendo	49	218,176	218,176
49		Tales of VS. テイルズ オブ バーサス	Namco Bandai	10	212,687	212,687
50		Puyo Puyo 7 ぷよぷよ7	Sega	21	209,600	209,600